PocketMiner 抗原精细分析

按抗原类别组织单结构结果，并对 PocketMiner 残基分数做表面暴露、糖基化邻近性和三维区域聚类

单结构预测网页
Work in progressThe surface and clustering analysis is real; PocketMiner inference currently comes from an uploaded per-residue score file.

输入抗原与模型分数

先用 PocketMiner 网页获得逐残基分数，再与同一份 PDB 一起上传。必须明确填写抗原链，抗体、VHH 或其他链不会进入分析

报告将在这里显示

  1. 检查分数数量与抗原残基是否一致
  2. 计算真实 SASA 与糖基化邻近性
  3. 聚类高分且表面暴露的三维区域
  4. 下载逐残基、区域和着色结构产物

结果语义

PocketMiner 分数描述模型预测的隐蔽口袋形成倾向，不是校准后的物理开放概率，也不是抗体结合概率。Review score 是结合 PocketMiner、相对 SASA 和糖基化邻近惩罚的透明研究筛选指标，候选区域仍需结构审阅和实验验证